第一章 绪论
1.1 课题的研究背景
为了利用和保存这些珍贵文献，建国后一大批学者开始对中医药古文献进行了大量的整理研究工作。时至今日，计算机科学迅速发展，社会已经进入信息时代。自上个世纪八十年代以来，中医古籍整理研究已经逐渐由传统的手工整理方式向数字化资源整理和建设的方向转变。借助信息科学技术来揭示中医药古文献中所蕴涵的信息资源，改变中医药知识信息的组织、存取和传播方式，加快中医药知识的传播速度，实现中医药古文献的数字化、网络化，既能够达到保存和利用古籍的目的，又能为用户快速的提供所需资料，实现中医古籍资源共享。然而这些文献和数据均以分散、零星、片面的状况存在，且多用自然语言表述。由于历史变迁，一些词语的内涵与外延发生了变化，同一词语的古今词义差异大；由于中国地域广阔，方言之间显著的差异和地域文化的差异，同一词语的概念定义不同；同时中医药词汇具有模糊性、歧义性、隐喻性、文学性等特点，一词多义、多词一义的情况在中医古籍中大量存在。这不仅使得现代人在阅读中医古籍时存在困难，也给信息的利用和共享造成了困难。
本体通过严格定义概念以及概念之间的关系来确定概念的精确含义，表达领域内共同认可的、可共享的知识。近年来，本体作为一种知识表示方法越来越受到重视。随着本体研究的升温，应用本体相关理论和技术解决中医药领域中存在的语法和语义异构等问题，实现中医药资源共享也日渐成为中医药信息化、数字化研究的热点。
存世的万余种中医药文献，上来自秦汉医家，下出自清末民国初期医家，均从不同角度发展了中医学理论体系。这些医籍是前人从各方面总结出来的临床经验和理论研究成果，凝聚了其毕生心血，是中医药理论和临床经验的渊薮，对研究其学术思想具有重要的作用。
傅山（1607-1684 年），字青竹，后改青主，号公它、啬庐、石道人、朱衣道人等。傅山于明万历三十五年（公元 1607 年）出生在山西阳曲西村一个书香世家，是明末清初伟大的思想家、书画家、医学家和学者，博通经史百家，兼工诗文书画，尤精歧黄之术，擅长内、妇、幼诸科。也是山西地方医学的主要代表。..................
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第二章 本体相关理论和方法
2.1 本体的基本概念
2.1.1 本体的概念
本体种类繁多，可以进行不同的分类。Mizoguchi等按照本体涉及的内容将其划分为领域本体、通用本体和任务本体三类。 等人按照本体描述的详细程度和领域依赖度两个维度来划分本体类型。（1）按照详细程度不同可将本体划分为两种类型：参考本体和共享本体。参考本体详细程度高，共享本体详细程度较低。本体，英文称 Ontology，原本是哲学上的概念，可以追溯到古希腊哲学家亚里士多德。他认为本体是存在的本质抽象，本体论是关于存在及其本质的理论。本体是客观存在的一个系统的解释或说明，它关心的是客观现实的抽象本质。
二十世纪九十年代初开始被研究者引入计算机界。自此以后逐渐成为知识工程、自然语言处理等诸多研究团体的热门课题。人们对本体的认识从了解到熟悉经历了很长一段时间，有关本体的定义也经历了一个不断深化的过程。
在人工智能领域，1991 年 Neches等人最早将本体定义为即“本体定义了构成相关领域词汇的基本术语和关系，以及结合这些术语和关系来定义这些词汇外延的规则”。1993 年，斯坦福大学给出了一个被信息科学领域广泛接受的本体定义，即“本体是概念化的明确的规范说明”。1997 年 Borst 进一步提出，“本体是共享的概念模型的形式化的规范说明”。1998 年德国卡尔斯鲁厄大学 Studer 扩展了 Gruber 的定义，提出“本体是共享的概念模型的明确的、形式化的规范说明”，基本上取得了信息科学领域的一致认可。 从以上可以看出，研究者给出的本体定义不尽相同，各有侧重。尽管如此，本体的概念基本包括以下方面：术语（词汇）、术语关系、规则、概念化形式化的规范说明、表达和共享。一个本体就是一套关于某一领域概念规范而清晰的描述，其通过对某个领域概念及概念间关系的严格定义，为计算机处理该领域信息提供方便。
一个本体（Ontology）就是一个正式的词汇表，其中定义了某一领域内或多领域专业词汇的含义及它们之间的关系。Ontology的核心作用就在于它定义了某一领域、领域之间的一系列概念和它们之间的关系。利用Ontology抽象的概念和术语，可以分析清楚该领域的知识结构。
2.1.2 本体的构成
Perez 等认为本体中的知识形式化主要由五部分构成：类或概念、关系、函数、公理和实例。1.类（classes）或概念（concepts） 本体中的概念是广义上的概念，既可以是一般意义上的概念，也可指任务、功能、行为、策略和推理过程等任何事务。2.关系关系表示领域中概念之间的一类关联，典型的二元关联如子类关系形成概念类的层次结构，一般用 R：C1×C2……×Cn，表示概念类 C1、C2、……Cn之间存在n 元关系 R。3.函数函数是一种特殊的关系。用 F：C1×C2……×Cn-1，→Cn表示。即该关系的前n-1 个元素可唯一决定第 n 个元素。4.公理公理用于表示一些永真式。更具体地说，在许多领域中，函数之间或关联之间也存在着关联或约束。 .............
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第三章 医学领域本体..................................................7
3.1 医学领域本体的概念...............................................7
3.2 国外医学领域本体的研究现状..................................7
3.2.1 一体化医学语言系统（UMLS） ...........................7
3.2.2 开放生物医学本体................................................7
3.2.3 SNOMED CT.........................................................8
3.2.4 生物医学调查本体.................................................8
3.3 国内医学领域本体的研究现状....................................8
3.3.1 医学知识库（NKI Med）........................................8
3.3.2 中文医学信息语义标引体系和语义检索模型.............8
3.3.3 中医药一体化语言系统（TCMLS）...........................9
3.3.4 基于本体的中医古籍文献研究..................................9
3.3.5 其他中医药本体.....................................................9
第四章 傅山医学本体的构建方法....................................10
4.1 傅山及其著作...........................................................10
4.1.1 傅山生平简介........................................................10
4.1.2 傅山著作考...........................................................11
4.2 傅山医学本体的构建................................................12
4.2.1 傅山医学本体的构建方法......................................12
4.2.2 傅山医学本体的构建工具和表示语言.......................12
4.2.3 傅山医学本体的构建思路........................................12
4.2.4 傅山医学本体的构建..............................................13
6.2 研究展望................................................................26
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总结
本文主要做的工作可归纳为以下几个方面：
（1）将本体思想引入傅山医学数字化研究中，为解决傅山医学中存在的语法和语义异构等问题提供新的思路；
（2）对近百篇国内外有关医学本体的研究进行了全面的分析，对医学本体、中医学本体的概念以及中医药领域运用本体取得的成果和最新的研究进展进行了研究；
（3）对本体的研究理论和方法进行了总结，然后通过对本体的构建方法和构建工具的比较，选择了适合本次研究使用的构建方法和工具。经分析比较，最终采用的是斯坦福大学医学院建立的七步法以及相应的本体构建工具Protégé4.1；（4）建立了基于本体的傅山医学知识组织和表示的形式和方法，然后以《傅青主女科》为例进行了实证研究，初步建立了傅山医学本体模型。
然而由于条件限制，构建方法没有实现自动化，而手工构建本体工作量巨大。初步建立了傅山医学本体模型后，仅以《傅青主女科》进行了实例研究。
参考文献
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