代写医学论文范文KPNA2调控WDR62可变剪接激活PLK1促进胃癌进展的机制探讨

发布时间:2023-09-26 08:48:12 论文编辑:vicky

本文是一篇医学论文,我们通过iRIP-seq发现KPNA2主要结合在WDR62 mRNA的GUGAG基序,但是目前并未通过实验验证;

第一章  KPNA2在胃癌中的表达及临床意义

1.1 实验材料与方法

1.1.1 实验细胞

本课题使用的细胞株有正常的胃黏膜上皮细胞GES和五株胃癌细胞(AGS、HGC-27、MKN-45、MKN-28和MGC-803)。六株细胞均购买自上海誉驰生物科技有限公司。

1.1.2 临床样本

本课题使用63例来源于兰州大学第一医院经手术切除的胃癌组织标本(癌组织和癌旁组织)。所有的样本均来自术前未经过放化疗,且经组织学确诊为胃癌的患者。所有参与者都签署了知情同意书,兰州大学第一医院伦理委员会批准了该研究(LDYYLL2022-2060)。

1.1.3 实验仪器

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1.2 实验结果

1.2.1 KPNA2表达水平在消化系统癌症中显著增加

为了研究胃癌的发生发展机制,我们以gastric cancer及RNA binding为关键词在Genecards(https://www.genecards.org/)数据库中进行检索,得到1650个相关基因,与已知的1455个RBPs基因取交集,得到827个胃癌相关的RBPs(图1-1A);通过GEPIA在线软件,将TCGA中619个胃癌样本分成癌和癌旁两组(癌症样品408个,癌旁样品211个),随后进行基因的差异表达分析,选取错误发现率(False discovery rate,FDR)≤0.01,|Log2FC|≥2作为显著差异的基因,共获得843个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs);将843个DEGs与827个胃癌相关的RBPs取交集,得到19个差异表达的RBPs(图1-1B)。使用R软件对TCGA数据库中部分RBPs在胃癌和正常组织中的表达情况进行分析,结果表明KPNA2、KRT18、PABPC1、FSCN1、CDKN2A和TOP2A等多种RBPs在胃癌中高表达(图1-1C)。

通过将gastric cancer和上述RBPs作为关键词,在pubmed进行文献搜索,发现KPNA2在胃癌中的功能研究较少。我们首先通过GEPIA数据库分析了KPNA2在消化系统肿瘤中的表达水平。我们发现KPNA2在大部分消化系统癌症中高表达(图1-2A)。为了研究KPNA2在胃癌中的可能作用,基于TCGA数据库我们发现KPNA2在正常的胃组织中低表达,在胃癌组织中高表达(图1-2B-C),来自TCGA数据库的患者的基本情况如表1-7所示。从HPA数据库中获得的免疫组织化学(immunohistochemistry,IHC)结果也表明KPNA在胃癌中高表达(图1-2D)。

第二章  KPNA2对胃癌生物学行为的调控

2.1 实验材料与方法

2.1.1 实验细胞

本课题使用胃癌细胞株有AGS和HGC-27。这两株细胞均购买自上海誉驰生物科技有限公司。

2.1.2 实验仪器

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2.2 实验结果

2.2.1在胃癌细胞中敲低和过表达KPNA2

为了研究KPNA2在胃癌中的潜在功能,利用siRNA和质粒构建KPNA2敲低和过表达的胃癌细胞系(AGS和HGC-27),使用RT-qPCR和western blotting实验验证转染效率(图2-1A-B)。

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第三章  KPNA2调控胃癌中相关基因的表达和可变剪接 .................. 33

3.1实验材料与方法........................... 33

3.1.1 实验细胞 ........................................ 33

3.1.2 实验仪器 .................................... 33

第四章  KPNA2调控WDR62可变剪接激活PLK1促进胃癌细胞增殖 ..................... 83

4.1 实验材料与方法........................... 83

4.1.1 实验细胞 ................................................ 83

4.1.2 实验仪器 ................................... 83

第五章  全文结论 ...................... 88

5.1 主要结论........................................ 88

5.2 研究不足与展望..................... 88

第四章  KPNA2调控WDR62可变剪接激活PLK1促进胃癌细胞增殖

4.1 实验材料与方法

4.1.1 实验细胞

本课题使用的细胞株有正常的胃黏膜上皮细胞GES和五株胃癌细胞(AGS、HGC-27、MKN-28、BGC-823和MGC-803)。六株细胞均购买自上海誉驰生物科技有限公司。

4.1.2 实验仪器 

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第五章  全文结论

5.1 主要结论

1. KPNA在胃癌细胞和组织中高表达,促进胃癌细胞的增殖、迁移和侵袭。

2. KPNA2调控WDR62可变剪接及表达。

参考文献(略)

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